首先，PCT申请是自优先权日起18个月，由国际局进行国际公布的，因此不存在在某些国家公开，在某些国家不公开的情况。

其次，根据2004年修改的细则，目前PCT申请提交时自动全部指定所有指定国。除非在国际申请提交后特别排除某些指定国，否则PCT申请自国际申请之日起，即在所有指定国享有一般国家申请的法律效力。

最后，PCT只是一个专利申请程序，而不是专利授予程序，最后的授权决定是由各个指定局作出的。故只有在指定局获得授权，才能够获得专利权的保护。